La protéomique consiste à l’étude de l’ensemble des protéines d’une cellule, d’un tissu ou d’un liquide biologique. L’étude peut être focalisée sur les protéines différemment exprimées selon l’état physiologique ou pathologique. Les méthodes d’étude du protéome sont abordées, en particulier l’approche classique alliant l’électrophorèse en gel bidimensionnelle (2-DGE) pour la séparation des protéines et la spectrométrie de masse permettant de les identifier. Quelle que soit l'approche choisie, la première étape d'une analyse protéomique consiste en une séparation des protéines de l'échantillon ou des peptides issus de la digestion de ces protéines. Dans le présent cours, nous allons aborder en détail les principales techniques utilisées en protéomique afin de séparer, purifier puis identifier les protéines.