Ce cours initie les étudiants à la science ouverte et à l’utilisation d’outils open source (Python, QGIS, GitHub, Biopython, Galaxy) pour analyser, visualiser et partager des données. Il met l’accent sur la collaboration, la reproductibilité et l’éthique scientifique, à travers un apprentissage pratique aboutissant à un mini-projet en open science.
Compétences visées
À la fin du cours, les étudiants sauront appliquer les principes de la science
ouverte, utiliser des outils libres pour la recherche, collaborer via GitHub,
analyser et visualiser des données avec Python et QGIS, et concevoir un projet
scientifique reproductible.
- معلم: Hassina MERABET
Description du cours
Le cours intitulé « Méthodes Moléculaires et Métagénomiques » s’intéresse aux technologies de pointe et aux méthodes d’analyses utilisées en biologie moléculaire et dans le domaine de la métagénomique. Il Permet de s’approprier les principes, les concepts et les outils pour l’analyse des génomes. Il concerne les méthodes moléculaires et métagénomique, en particulier la génomique structurale et fonctionnelle, les marqueurs moléculaires et leur utilisation ainsi que l’expression des gènes du génome. Il s’intéresse aussi à la science des Omiques, leur principe, outils et méthodes d’analyses bio-informatique.
Intitulé de l’UE : UEm11 : Méthodologique
Crédits : 4
Coefficients : 2
Prérequis
Avant d'entamer le cours de Méthodes Moléculaires et Métagénomiques, des connaissances préalables sont recommandées pour les prérequis suivant :
Biologie moléculaire, génétique, microbiologie, biologie cellulaire, Biochimie, biophysique, immunologie, chimie organique et minérale, immunologie, biologie animale et biologie végétale.
Objectifs
- Acquérir les
notions de base en génomique et en métagénomique
- Comprendre
les approches expérimentales à grande échelle fondées sur la biologie moléculaire
et la chimie analytique
- Illustrer les
différentes techniques utilisées en génomique et en métagénomique
- Comparer et
explorer en profondeur les différentes méthodes de manipulation utilisée dans
l’analyse génomique et métagénomique.
- Analyser le rôle des différentes approches utilisées pour chaque technique et évaluer l’efficacité d’une technique d’analyse, ces avantages et inconvénients.
Programme
I. Structure et dynamique des
génomes
II. Marqueurs moléculaires et
exemples d’utilisations
III. Génomique structurale et fonctionnelle
IV. Protéomique
V. Métabolomiques
VI. Métagénomiques
- معلم: Wassila AIGOUN
Méthodes d’analyses médicales est un cours qui initie les étudiants aux principales techniques utilisées en laboratoire de biologie médicale. Il met l’accent sur la compréhension des principes de chaque méthode d’analyse ainsi que sur la maîtrise des protocoles expérimentaux appliqués aux domaines de la biochimie, de l’hématologie, de l’immunologie et de la microbiologie. Ce cours permet aux étudiants de développer des compétences pratiques indispensables à la réalisation, à l’interprétation et à la validation des analyses, tout en respectant les exigences de qualité, de sécurité et de traçabilité en laboratoire.
- معلم: Delel MEKHALDI
Unité Fondamentale
Crédits : 6
Coefficients : 3
Objectifs
Connaitre les différentes espèces bactériennes impliquées dans les pathologies infectieuses humaines et les techniques de diagnostic bactériologique
Prérequis
Les notions de base de biochimie, immunologie et physiologie ainsi que de microbiologie générale.
Programme
Le module est divisé en 4 grandes parties
- Rappels et Notions de bases de l'infectiologie
- Les maladies infectieuses et les bactéries incriminées
- Les méthodes de diagnostic bactériologique
- Les antibiotiques
- معلم: RAAF Naima
- معلم: Naïma RAAF