Semestre 1

1- Présentation du cours Méthodes moléculaires et métagénomiques:

Les approches moléculaires de métagénomique permettent d’analyser une communauté d’organismes dans sa globalité et d’étudier une niche écologique complexe de façon exhaustive : une approche puissante et innovante, pour caractériser les gènes et donc les fonctions biologiques qui existent dans le milieu et portées par ces microbiomes.

Ce cours intitulé « Méthodes Moléculaires et Métagénomiques» Permet de s’approprier les principes, les concepts et les outils pour l’analyse des génomes. Il concerne les méthodes moléculaires et métagénomique, en particulier la génomique structurale et fonctionnelle, les marqueurs moléculaires et leur utilisation ainsi que l’expression des gènes du génome. Ce cours évoque aussi la science des Omiques, leur principe, outils et méthodes d’analyses bio-informatique.

Le cours est scindé en un ensemble d’unités d’apprentissage qui va permettre aux étudiants d’acquérir des compétences en matière d’utilisation de différentes techniques et méthodes moléculaires.

Il permet aussi d’exposer aux étudiants les outils et méthodes d’analyses moléculaires en faisant recours aux recherches de pointe dans le domaine de la génomique et métagénomique.

2- Publique cible: Ce cours est destiné aux étudiants de M1, spécialité microbiologie appliquée.

3- Visés d'apprentissage du cours MMM:

La compétence visée par ce cours, dans son ensemble, est « d’être capable de comprendre, d’analyser et comparer les différentes techniques et méthodes en relation avec la génomique et la métagénomique ». C’est une performance complexe, que vous allez construire progressivement en maîtrisant des savoirs, en mettant en œuvre des savoir-faire et en le faisant avec un savoir-être de professionnel.

Le cours Méthodes Moléculaires et Métagénomiques vise à :      

-      En terme de connaissance, ce cours va vous permettre d’acquérir les notions de base en génomique et en métagénomique, ce qui permettra de vous fournir une base solide de connaissances théoriques sur la protéomique que les étudiants pourront ensuite appliquer dans les exercices et dans leurs études ultérieures.

-      Comprendre les approches expérimentales à grande échelle fondées sur la biologie moléculaire et la chimie analytique ce qui vous permettra de renforcer votre compréhension et votre rétention des informations.

-      Illustrer les différentes techniques utilisées en génomique et en métagénomique ce qui vous permettra de vous familiariser avec ces pratiques de ces techniques

-      Comparer les méthodes de manipulation utilisée en génomique et métagénomique ce qui vous permettra d’explorer en profondeur les différentes méthodes de manipulation utilisée dans l’analyse génomique et métagénomique.

-      Analyser le rôle des différentes approches utilisées pour chaque technique ce qui vous permettra d’évaluer l'efficacité, d’une technique d’analyse, avantages et inconvénients. LA figure 1 illustre la visée du cours.